万历皇帝清算张居正的时候，张居正已经去世了。万历皇帝做的这件事，是有些让人不太明白的。
我们知道，皇帝之所以要清算某个大臣，无非是这个大臣专权，影响了皇帝的“自由发挥”，让皇帝无法实现中央集权。因而必须要把这个权臣扳倒，权力才会回到自己手中。
但是，张居正已经死掉了，已经不可能对万历皇帝的权力构成威胁了，他为什么还要清算张居正呢？
历史上曾经发生过类似的情况。
霍光没死的时候，朝中大事小事都是由霍光做主，并且还把自己家族里的很多人，都放在朝廷中当官，形成盘根错节的权力网。汉宣帝非常不高兴。不过，汉宣帝虽然不高兴，但由于霍光及其家族权力太大，所以他也把霍光没有办法。霍光一死，汉宣帝就开始清算，把霍光家族的人一网打尽。
汉宣帝之所以要这样做，无非是想夺回权力，所以我们还是比较理解的。
不过，汉宣帝虽然把霍光家族一网打尽，但是他并没有否定霍光，而且还让霍光进入了麒麟阁，这就是汉宣帝对霍光的充分肯定。汉宣帝这样做，也让很多人对汉宣帝很有好感，历史上对汉宣帝的评价也比较高。
万历皇帝虽然说也遇到了同样的情况，不过他所遇到的情况，与汉宣帝遇到的情况，区别还是很大的。因为张居正并没有像霍光那样，让他的家族盘踞在朝廷中。朝廷中当然有一些张居正的部下，但是也并不是很多，也没有绝对掌控朝廷，对万历皇帝的权力不构成威胁。也就是说，张居正一死，实际上权力就已经回到了万历皇帝的手里。
既然权力已经回到万历皇帝手里，万历还有什么必要打击张居正，抄张居正的家，流放并饿死张居正的家人呢？
而且，万历皇帝这样做，其实还是有些得不偿失的。因为当时万历皇帝还想对张居正进行开棺鞭尸。这件事在朝中引起了极大的反响，很多人都上书万历，认为不应该这样做。万历皇帝遇到的阻力太大，因而才最终不了了之。
可以说，汉宣帝对霍光的处理，获得了朝中大臣的拥戴。而万历皇帝对张居正的处理，却在朝中引起了反感。
既然如此，为什么万历皇帝还要这么做呢？
其一，万历皇帝的成长阴影。
万历皇帝由于是小皇帝，张居正在当首辅的时候，既要处理朝廷的大事，又担负着教育万历皇帝的重任。
万历皇帝小时候特别调皮，不喜欢学习，贪玩好耍。他的母亲李太后把他根本没有办法，于是就经常吓唬他，说，如果你不专门读书，就把张居正找来收拾你。而且确实经常把张居正找来解决问题。虽然张居正每次也就是跪在地上，苦口婆心地劝说万历皇帝，并不敢怎么样他。但是，这无疑在万历皇帝心中，引起了对张居正极大的反感。
这种反感是万历皇帝成长过程中的一道阴影。张居正活着的时候，他把张居正没有办法。张居正一死，他立刻就开始报复张居正，要对张居正进行开棺鞭尸。
其二，明朝激烈的朋党之争。
明朝由于没有宰相，因此朋党权力之争特别严重。
为什么严重呢？道理很简单，如果有宰相，毕竟宰相的职位在那里，大家就算对宰相不满，也还是比较听宰相的话。但没有了宰相，大家的地位就都是差不多，都是阁臣。虽然有个首辅，但是首辅地位和其他阁臣是差不多的。既然都差不多，凭什么我们得听你的？
而张居正活着的时候，他是比较专权的。专权的意思，显然就是会代表一个朋党，打压另一个朋党。只有这样，才能实现专权的目的。但是张居正去世后，另外这个朋党要站起来，自然必须把张居正所代表的朋党打下去。打下去了，才能形成新的权力中心。所以，他们才会猛烈攻击张居正。
其三，万历皇帝要破坏张居正的形象。
万历皇帝为什么要破坏张居正的形象呢？
因为张居正活着的时候，他是一个中心。大家都知道这是个中心，万事都应该听张居正的，张居正说了就算。
现在张居正去世了，照理说，万历皇帝就做大了。其实不一定，因为别的大臣可能会效仿张居正，形成一个新的中心。万历皇帝当然不愿意这样的情况在朝廷中出现，他想要建立自己的中心，形成自己的高度。因此，尽管张居正已经去世，但还需要破坏张居正的形象。只有破坏了张居正的形象，别的大臣才不敢向张居正学习，万历才能建立自己的威望。