1891年对国父孙中山先生来说是一个幸运的年份，这一年的十月份，他唯一的儿子孙科诞生，孙科也是孙中山的第一个孩子，同时也是孙中山唯一的儿子。之后孙中山先生又陆续生了几个孩子，不过全部都是千金。
因为是唯一的儿子，所以孙中山先生对孙科的管教甚为严格。孙中山先生常年干革命，相对来说对子女的管教较少，但是即使这样他也不忘督促孙科读书。孙科在孙中山先生的教导下形成了良好的读书习惯，他时刻以“读正义书养浩然正气”，孙科也成为了当时国民“行政院”为数不多的喜欢读书的人。
孙科小时候即被孙中山送到美国读书，他在美国接受了系统的教育，成年后孙科回到国内，跟随孙中山先生一起干革命。他虽然是孙中山先生的儿子，但是却从来没有受过特殊对待，相反，孙中山先生更鼓励孙科从基层干起，一步一个脚印。
关于孙中山对孙科的严厉教诲还有一个流传甚广的故事。孙中山成立广州国民革命后于1921年任命孙科为广州市市长，当时国民革命的根据地就是广州，这个广州市市长的职位可以说位高权重。
1923年，孙科在市长任上因为筹集军饷不力被孙中山责骂，当时的孙科以为是元老胡汉民从中挑拨他与孙中山先生的父子关系，因此就举起自己的手杖打了胡汉民。这件事被孙中山获悉，孙中山又惊又怒，认为自己教子无方，一把从卫士手中抢过了卫士的，当场就要枪毙孙科。
好在有人及时拦下了孙中山，避免了惨剧发生。从这件事我们也可以看出孙中山对孙科的教导是很严厉的。哪怕孙科是孙中山的儿子，只要他犯错，孙中山也一样会对他严厉惩罚。
1925年，孙中山去世。孙中山去世后，孙科与汪精卫在广州成立国民革命，对抗蒋介石的南京国民革命。不过广州很快就因为经费问题倒闭，之后孙科成为南京国民的“行政院长”，但是因为广州的问题，孙科与蒋介石一直面和心不和。
1949年，蒋介石下野时除了桂系军阀李宗仁的逼迫之外，还有另一个原因就是孙科的参与，当时孙科支持和平谈判，在内部成为了与蒋介石、李宗仁三足鼎立的另一支力量，不过孙科的政治经验毕竟少，很快就被迫辞职。
也因为这件事，蒋介石在败退台湾后孙科并没有第一时间跟随蒋介石到台湾，他先是到了美国，在美国居住了一段时间。孙科身上有个优点，这个优点是继承了他父亲孙中山的，那就是不蓄私财。这导致孙科没有任何积蓄，他在美国过着清贫的日子。1965年，在蒋介石的同意下，孙科前往台湾居住。
孙科到台湾后生活有所改观，这是因为蒋介石让孙科出任了台湾的“考试院院长”，孙科到台湾后主要从事教育事业，在担任“考试院院长”后继续担任了东吴大学的董事长。
不过晚年的孙科身体一直不好，最终于1973年因心脏病去世，享年82岁。