北洋武备学堂从创立到八国联军入侵时停办为止，培养军事人才千余名。北洋武备学堂的办学方针、学校体制、教学内容，为以后的各类陆军学校所沿用和参照，其开创性作用不言而喻。袁世凯北洋军阀集团的高级骨干，如段祺瑞、冯国璋、王士珍、曹锟、段芝贵等核心人物，大多都出自北洋武备学堂，中下级军官则基本上来自小站时期的随营学堂以及清末的北洋陆军各学堂。在北洋军阀把持的民国北京期间，出自北洋武备学堂的总统、总理、总长，要人之多，如过江之鲫，一时无两。
甲午战争后，朝廷严谕各地督抚按“西法”抽练新军，裁撤旧军。在“练兵必先选将”思路的指导下，各地在两三年内先后建立了一系列军事学堂。其中，张之洞先在南京设立了江南陆师学堂，后又在武昌创办了湖北武备学堂。广东、浙江、安徽、山西、湖南、四川、陕西、奉天、吉林等省也纷纷设立了武备学堂。清军中几支程度较好的部队里也都设有随营学堂，除了袁世凯的武卫右军外，聂士成的武卫前军、宋庆与马玉昆的武卫左军都设有随营学堂。但好景不长，1898年戊戌变法失败后，守旧派当政，各省武备学堂的开办陷入低潮。
庚子国难中，被炮火焚毁的北洋武备学堂外景，约摄于1900年庚子事变后，为形势所迫，慈禧太后决定实行新政。1901年9月11日，清廷颁发上谕：“现在整顿兵制，停止武科，亟应于各直省会建立武备学堂，以期培养将才，练成劲旅。”此后两三年内，除原已设立武备学堂的省份外，没有开办的各省也纷纷兴办。到1904年，全国除了东北三省的主权尚未收回、广西省尚在筹办外，其余内地各省均已成立了武备学堂或相当的军事学堂，共有二十余所，其中直隶、江苏及湖北三省均在两所以上。