元丰二年八月，苏轼因乌台诗案，“谤讪朝廷”罪被捕入狱。时苏辙随南京留守张方平，为签书应天府判官。
随之，苏辙上书，欲以自己的官职为兄赎罪。因为，受苏轼案子的牵连牵，他被贬为监筠州盐酒税，且五年内不得升调。
元丰五年，苏辙专程去黄州看了哥哥，这一见，彼此欢喜无比。五年不见了，五年前，苏辙随张方平在南京，当时苏轼知徐州，苏辙去徐州，并留居了一百多天。
而五年后，黄州再会，俩人一道游览了黄州及武昌西山。次年，苏辙创作了《黄州快哉亭记》。
神宗殁后，旧党当政，苏辙以秘书省校书郎被召回，后又任右司谏。司马光、吕公著为相，尽行废除新法。司马光废免疫法，想恢复差役法，而差役法之害相当于免疫法。苏辙上书反对，列举得失，全然不以司马光所虑为听。因王安石变法，天下士子皆以《诗经》、《尚书新义》为学问。司马光想改变科举，另立新例。苏辙说：“进士考试，就在来年秋天了，已经没有多少日子供他们选择了。学习经书不是轻易的事，随便一改，士子无法适应。”司马光不听，且不以为然。
元祐六年二月，任中大夫、守尚书右丞，苏辙入相。
绍圣元年，哲宗恢复熙宁新法，苏辙上书反对，被贬知汝州。再贬苏辙为左朝议大夫、知袁州。又贬为左朝议大夫、试少府监，分司南京，筠州居住处分。
绍圣四年二月，又被贬为化州别驾，安置雷州处分。此时，苏轼贬为琼州别驾、昌化军安置。五月十一日，兄弟二人会于岭南。六月十一日，苏辙送苏轼赴海南，兄弟诀别于海滨。此别，两人再也不能相见，各自彼此怀想。元符元年，移至循州安置。元符三年，宋徽宗即位，苏辙移永州、岳州安置。如此贬，让苏辙何以自安？操刀者，章惇也苏辙少年时，从道士处得养生法，他少年时，病肺，中年病脾，晚年，“二疾忽已平”，为什么如此呢?苏辙认为是摆脱了百欲、明白了“道”的缘故。苏辙42岁时，作《老子解》，把诸子百家思想融会于道家。苏辙说：“老佛之道，非一人之私说也，自有天地，而有是道矣。”朱熹对苏辙的这一看法十分不满，他认为苏辙“合吾儒于《老子》，以为不足，又并释氏而弥缝之”苏辙与朱熹之间的分歧：一、苏氏兄弟想以道家为本，融合儒佛；二、而朱熹想以儒家为本，融合道佛。
苏辙传世墨迹有《雪甚帖》、《雪诗帖》、《车马帖》、《晴寒帖》等。
苏辙，字子由，一字同叔，晚号颍滨遗老。眉州眉山人。