这里还是我国道教发源地之一，据说春秋时期，老子西出函谷关后，就是在瓦屋山隐居。汉代张道陵在瓦屋山创立五斗米教，并且留下《张道陵碑》。明朝时期，张三丰到瓦屋山修行，并且创下“屋山派”从古至今瓦屋山都吸引了很多名人骚客来访，因此也为瓦屋山留下了许多珍贵的诗词名句，和以秀美闻名天下的峨眉山遥相辉映，并称为“蜀中二绝”
但谁能想到，它竟被称为“妖山”，在明清两朝被封山四百多年。传说瓦屋山居住着很多妖怪，常年被黑雾笼罩，经常发生一些离奇惨剧。很多进山采药、打猎的人，或是信男信女，都无缘无故地在山中死去。当地人认为是山中的道士谋财害命，群起抓住了观中的道士报官，并且烧掉了道观。当地官府进行了详细的调查，发现与道观毫无关系，而且都是死在同一个地方的。这个地方，就是瓦屋山东南方一面积约1000亩的区域，好像是从平地隆起如馒头状的土丘。于是人们把这个地方叫做“迷魂凼”
迷魂凼地形复杂、地质异常，一旦进入，所有的罗盘都会失灵，手机、GPS没有一点信号，只见路径复杂，湖泊纵横，难辨方向，犹如魂魄丢失，不知不觉的就失去了应有的判断与理智，基本都会迷失方向，最后失踪或者死亡。曾有科考队释放信鸽，进行信鸽验证，结果鸽子不敢飞走，屡次降落到科考队队员头上、肩膀上。从古至今，有很多不信邪的人执意进入迷魂凼，但从来没有一个人回来过，所以从明朝开始，迷魂凼作为禁区整整封闭了四百年。
1970年9月中旬，一个经验丰富的当地猎人带猎狗进入迷魂凼。不仅本人失踪，机灵的猎狗也不见踪影。
1972年4月17日，瓦屋山脚下两个妇女上山挖药材闯进偏僻的迷魂凼，随后失踪。
1974年10月31日，洪雅当地组织的野生动物资源调查小组，进入迷魂凼原始森林迷路。
1975年7月13日，野生动物资源调查小组再次进入迷魂凼，依旧迷失方向。
1979年，四川省林业厅一位专家带领省森林调查队误入迷魂凼。在该区域走了3天3夜，最后用刀硬生生砍出一条“生命线”才跌跌撞撞走了出来，进入邻近的荥经县。
1990年6月13日，世界动物基金会顾问、国务院特聘大熊猫保护专家安德鲁·劳里博士一行七八个人，进入迷魂凼腹心地带考察，由于罗盘失灵，原本计划朝向西方前进，走了很久还是停留在原处。
当地人都说瓦屋山存在一条“迷魂道”，一般人进去就出不来了。“迷魂凼，奇中奇，进得里面来，生还不容易。”许多年来，“瓦屋山迷魂凼”给世人留下一串串难解之谜，也引起了国内外专家学者、旅游探险者以及多方人士的浓厚兴趣。曾经有胆大的探险者试图穿越迷魂凼，可是一进入，就发现手机、GPS都没有一点信号，手表里的指针不听使唤地左右摇摆，脚下的断树上堆满了积雪，且满布青苔，不断地有人踩滑摔倒。结果，前进了不到100米，这群探险者就不得不放弃。
中央电视台、湖南卫视、四川卫视等电视台也对迷魂凼进行报道并实地拍摄。随着节目的播放，人们对迷魂凼更加敬畏和迷惘。于是关于瓦屋山迷魂凼之迷，一时众说纷纭，给出了很多不同的解释，比较有代表性的是以下几种。
神话说——瓦屋山迷魂凼是五斗米教的创始人张道陵当年在瓦屋山传教的时候设置的八卦迷魂阵。当然，这仅是传说而已，一看就不可信。
瘴气说——瘴气是指动植物腐烂在沼泽地产生的甲烷等有毒气体，会使人缺氧，出现头晕等中毒症状。
视幻说——这是因为瓦屋山的植被资源丰富，丛林茂密，再加上周围地形、植被都差不多，使得人在视觉上感觉周围景观完全一样，没有方向参考，同样的情景在不同地方出现，让人进入视觉幻象，也就是俗话说的眼睛被骗了。
当然，这些仅仅是假说而已，都只是推测，并没有科学依据，而且，每一种假说只能解释某种现象，而无法彻底解开瓦屋山迷魂凼之谜，但这不就正是瓦屋山吸引世人的神奇魅力所在吗。也正是因为迷魂凼的神秘恐怖，当地在开发瓦屋山资源时，不得不将其划为旅游禁区，防止游人误入迷魂凼。
不久，他们注意到身后有浓密的雾气正向他们靠近，没有丝毫犹豫，两人撒腿就跑。但仅仅几分钟，他们就被雾气笼罩了，雾气是黑色的，就像是塑料燃烧时的黑烟。渐渐地，雾气更浓了，直到双方面对面也根本看不到对方，只能通过声音来辨别出对方的位置。黑雾来得迅速而诡异，两人都恐惧万分，怕被瘴气缠绕过久而致命。慌乱中，两人不顾方向，只想立刻逃离黑雾的包围。不知道跑了多久，兰溪变得越来越窄，水越来越少，当意识到跑得太远准备往回走时，却已经迷失在了丛林之中。
李俊意识到可能是进了迷魂凼了，事态已经完全脱离了他的掌控，因为想走出迷魂凼，谈何容易！浓厚的雾气、消失的脚印、莫名失灵的手机，两人越来越胆战心惊，只想马上逃出这里。李俊在前面找路，张胜开紧跟在后面，两人爬过了一个又一个山包。忽然，李俊发现了前方有两根烟头，那是刚才他们两人休息时抽完灭掉的，两人绕了一个大圈。
好在不久之后，当张胜开和李俊都已经没剩下多少体力的时候，雾慢慢地散了，越来越淡，但是天也黑了下来。箭竹林高大茂密，根本无法用树叶的茂密和稀疏的办法来辨别南北方向；想找参照物，但每次看见的，都感觉是同样的山包。平日辨认方向的办法，在迷魂凼里根本派不上用场。最后凭着李俊在瓦屋山多年的经验，顺着流水声找到了一条小溪。在溪边稍做休息的时候，张胜开发现了不远处的一棵树上挂着一包红色的东西。这包东西就是他一早装着灵芝的袋子，两人终于走出迷魂凼，找到回家的路了。
迷魂凼之所以这么离奇，张胜开认为主要有三点：一是瓦屋山是一座矿藏丰富的方山，产生的巨大磁场导致指南针失灵，手机无信号等；二是迷魂凼地处瓦屋高原原始森林的腹部，千百年来人迹罕至，枯死的树木积埋地下，发出能致人昏迷的獐气，使人出现昏迷而产生幻觉；三是迷魂凼特殊的地形地貌，导致里面有许许多多大小、形状几乎一模一样的小山包，犹如一个天然的迷魂阵。人们进去，就很容易迷失方向而在里面转来转去地空消耗体力，最后丧失了性命。其实，就是磁场、瘴气和视幻三种说法的合一。