博尔塔拉州辖博乐市、阿拉山口市、精河县、温泉县共2市、2县。库尔勒市为巴音郭楞州的州府。
博乐市为博尔塔拉州的州府，现有户籍人口19万。博乐市人口密度24人每平方公里，“容积率”很低，但在博州最高，低于库尔勒。全市7990平方公里，分为5个乡镇和5个街道，乡镇街和人口主要位于博尔塔拉河附近的绿洲中。市区包括南城区、青达拉、青得里等5个街道，海拔约510米，周边有好几块兵团双河市的飞地。离市区最近的镇为青得里镇，人口2.3万，附近还有小营盘镇，人口2.6万，这两个镇是市区外的最大镇。博乐市通了高速公路和铁路，附近还有一座阿拉山口机场。
阿拉山口市现有户籍人口0.3万，是全国人口最少的县级市之一。人口密度3人每平方公里，十分稀疏。全县1204平方公里，包括1个街道和1个镇。城区为阿拉套街道，位于艾比湖畔，另一个镇即为艾比湖镇。阿拉山口为沿边城市，有铁路通往对面的哈萨克斯坦。阿拉山口海拔约310米，两侧的山区海拔上千，因此这个山口十分重要，中哈两国已经议定扩能，东侧建设到精河县的铁路二线，以满足中欧班列的运输需求。
精河县现有户籍人口11.5万，人口密度10人每平方公里，十分稀疏。全县平方公里，分为5个乡镇。县府驻地精河镇，位于精河畔，同时也处于精河、博尔塔拉河等汇入艾比湖所形成的的连片绿洲中，海拔约320米，人口约2万。县城外的大河沿子镇距离博乐市区较近，也位于县城通往霍尔果斯口岸的高速公路附近，有出入口，人口达到3万。县里另两个镇为托里镇和托托镇，通过连霍高速与县城连接。
库尔勒现有户籍人口48万，人口米都人每平方公里。全市7379平方公里，分为12个乡镇和7个街道。市区包括天山、团结、新城、建设、朝阳、梨香、萨依巴格这7个街道，位于孔雀河畔，海拔约910米。孔雀河水源来自天山南坡的博斯腾湖，博湖以及孔雀河各自形成大片的绿洲。塔什店镇位于博湖旁边，另两个镇西尼尔镇和上户镇位于市区周边，工业发达，但3个镇的人口都不多，都不到1万。库尔勒市农业以香梨闻名，有一座梨城机场，工业则以塔里木油田闻名，已经建成铁路和高速公路的交通枢纽，其内还划出两片区域建设了铁门关市。
在5地之中，库尔勒GDP655亿元高居第一，博乐市174亿元排在第二。精河县90亿元居中，与阿拉山口84亿元差距不大。温泉县29亿元最低。换算到人均GDP，阿拉山口因为人口少且口岸外贸量大，人均GDP最高。库尔勒人均13.5万元屈居第二。博乐市作为州府以9.2万元居中。精河县人均7.8万元高于温泉县的4.1万元。