记载顺治皇帝生平活动的《清世祖实录》中有一段关于顺治帝死前的最后记录：顺治十八年正月初一，顺治皇帝免去群臣的朝贺礼仪，而且祭祀太庙的仪式，也委派官员前往，而正月初二这一天，顺治帝感到身体不适，到初六已是大渐。大渐这个词，在古代是专指帝王病危的，而就在初六的夜里，深宫就传出了顺治驾崩的消息。对于顺治的突然驾崩，广为流传的有几种说法。
因情病逝说：都说自古才子多风流，窈窕淑女君子好逑，普通人也是如此，而对于权力至高无上的皇帝也不例外。民间流传着这样一个说法：相传顺治皇帝迷恋上了一个名字叫做董小宛的江南名妓，并立她为贵妃，而顺治的母亲孝庄皇太后，对于这件事极度不满，如果传了出去，就会严重损坏皇家的颜面。于是，孝庄皇太后设计害死了董小宛，顺治皇帝悲痛欲绝，最终不治而亡。
患天花病逝说：据记载，顺治八年的冬天，京城内爆发了大规模天花，死亡的阴影笼罩整个紫禁城，顺治皇帝也不得不远离京城。天花本来传染性极强，但在山海关外地广人稀，疾病传播的机会相对较少，而在满族入关之后，中原地区病菌的传播就比较厉害，加上水土不服，所以顺治被传染上也是很有可能的。
在大学士王熙的《自撰年谱》中，提到了顺治是因天花而去世的。他写到，在他应召进入养心殿后，病榻上的顺治帝对他说：朕得了痘症，恐怕是好不了了。所谓的痘，就是指天花，顺治皇帝从患病到驾崩，一共只有五天时间，他的病症和天花极为相似。顺治年间，一个叫张宸的官员的个人笔记中写到过，正月初七这一天，也就是顺治驾崩后的第二天，朝廷在传谕大赦的同时，还传谕民间不许炒豆、不许点灯、不许倒垃圾，而这些禁忌只有在皇帝出痘的情况下才会出现，京城内外出现了这种情况，这与大学士王熙的《自撰年谱》中记载的也是基本相吻合的。所以史学家们更认同顺治皇帝是因为患天花病逝的。
出家说：当顺治皇帝和董小宛的故事在民间广为流传时，人们不禁猜想，吴梅村在诗中所写的陛下，会不会就是顺治皇帝呢？除此之外，诗中还有这样一句：“王母携双成，绿盖云中来”，根据《汉武帝内传》记载，里面的“双成”全名叫做“董双成”，是传说中王母娘娘的侍女，那这里的“双成”指的又是谁呢？《清凉山赞佛诗》中还写到，可怜千里草，萎落无颜色。千里草，草下千里重叠，这明显是指一个“董”字，再联想到诗中提到的“双成”，全名叫做“董双成”，而千里草映射出的又是一个“董”字，于是人们就更加地确信，诗中所说的“妾”指的就是董小宛，而陛下当然就是深爱着董小宛的顺治皇帝了。
关于吴梅村诗中写到的一句：“八极何茫茫，日往清凉山”根据吴梅村的笔记记载，诗中的清凉山，指的其实就是佛教的圣地五台山，综合来看，吴梅村是否在暗示，顺治皇帝并没有死在宫中，而是瞒着所有人去到五台山出家了。
印证出家说：顺治特意在京城西苑，也就是今天的中南海，为别山法师辟出了一处万佛殿，供其前来修身，可别山法师却仅仅入宫作了礼节性的拜访后，又回去他的山洞了，这使顺治非常感动，于是思想逐渐超脱了凡俗，一心向佛，也将尊贵的皇帝之位视为过眼云烟了。
顺治十四年，二十岁的顺治皇帝在京师海会寺，同临济宗的高僧憨璞聪会面，这次会面，两人相谈甚欢，憨璞聪对佛法的阐释深深触动了顺治。从此，顺治对佛教便产生了更加深厚的兴趣，并请憨璞聪奏列了江南各大名寺的高僧姓名和情况，开始请临济宗的高僧入宫阐释佛法，其中对顺治影响很大的僧人是浙江湖州，报恩寺主持玉林琇，浙江宁波天童寺主持木陈忞，以及玉林琇引荐的弟子茆溪森，在这些僧人的包围阐释下，顺治从佛教中得到了深深地精神慰藉，并逐渐转变了自己的思想信仰。顺治皇帝拜玉林琇为师，并请他为自己起了一个法名行痴，玉林琇的大弟子茆溪森不仅成为了顺治的师兄，更因为他自身高深的修行和学识而受到顺治深深的信赖。据这些僧人记载，顺治皇帝已经在思想上完全接受了佛教关于生死轮回，因果报应的观念，如果想脱离轮回，就只能通过修悟佛法的教义，因此他认为自己的皇帝之位，也只不过是世俗之中的过眼云烟，来世并不知道会身在何处，所以他在受到重创后出家的念头，也许就是他思想信仰的结果。
除了以上的印证外，史书中也有相关的印证。据《起居注》记载，康熙即位不久后，孝庄皇太后曾多次带着他上五台山礼佛，这类的活动本来可以在北京举行，但他们却不远千里去到五台山，并且还去过很多次，由此看来，顺治在五台山出家修行，也许才是隐藏在礼佛背后的真相，而这也正好可以解释吴梅村在诗中写到的“日往清凉山”在庚子之变的时候，慈禧太后西逃到山西北边的时候，向五台山借了一些生活上的用具，有人说那些用具跟宫廷用具非常相似，很可能是顺治皇帝当年用过的，这就又给顺治在五台山出家的说法增添了一道论据。
康熙和孝庄的五台山之行，神秘的御用器具，还有民间关于顺治皇帝与董小宛的爱情传说，这些都在印证着《清凉山赞佛诗》中的影射。顺治在临终前命大学士王熙草拟并钦定的《最己诏》中充满了顺治皇帝的自责，“经营殿宇，靡费甚多，燕处深宫，御朝绝少，自恃聪明，不肯纳谏”等先后开列了多达十四条“朕之罪”
三百多年的时光已经过去了，那段关于顺治死亡的历史在岁月的流逝中愈发模糊不清了，究竟是什么夺走了年轻皇帝的生命，又或是真的如民间流传那样顺治出家之后晚年善终，也许永远也无法得到准确的答案。人们只能依靠着史料当中的零星记载尽可能地去还原那段未知的历史，为了爱情遁入空门，或许只是充满想象力的传奇，也是民间人们对痴情皇帝的一种念想，从史学角度来看，似乎死于天花的说法更为可信，但历史正是因为有了很多难以猜测的谜题，才会显得更加耐人寻味。